Wie in Woubrugge de schop in de grond zet, komt vooral veengrond tegen. Woubrugge staat op veen in de Oudendijkse polder, zo slap dat zelfs de Dorpskerk in 2014 nieuwe funderingspalen nodig had omdat de oude houten palen waren weggerot. Voor grondwerk betekent dat consequent ontwateren, zandfundering in dunne lagen verdicht aanbrengen en zwaardere constructies nooit rechtstreeks op het veen zetten.
Een vooroever van palen met vlechtwerk vormt een kamer die met grond of bagger kan worden gevuld, zodat voor de oude oeverlijn een nieuwe flauwe zone ontstaat zonder het achterland te vergraven. De plas-draszone wordt uitgezet ten opzichte van het vastgestelde polderpeil, en doordat dat peil in de veenpolders rond Woubrugge vastligt, blijft de waterdiepte in die zone jarenlang voorspelbaar. Een natuurvriendelijke oever op veen ontwikkelt zich richting moerasvegetatie met riet, zegge en lisdodde; die soorten vestigen zich grotendeels vanzelf zodra de plas-draszone op de juiste diepte ligt. De helling van een natuurvriendelijke oever kan deels onder water worden uitgevoerd, waardoor het talud in het natte profiel ligt en er boven water minder perceelbreedte verloren gaat. Golfslag van vaarverkeer vreet vooral aan de vezelige veenlaag net onder de waterlijn, waardoor de bovenliggende zode gaat overhangen en uiteindelijk in brokken afbreekt. Losgeslagen veenbrokken blijven drijven en verzamelen zich benedenstrooms bij een duiker of een hek, waar zij de doorstroming beperken en bij een hoge afvoer voor opstuwing zorgen.
Daar komt de waterstand bij. Het dorp ligt aan weerszijden van de Woudwetering, boezemwater dat in open verbinding staat met de Braassemermeer en de Wijde Aa, met daaromheen de laaggelegen Oudendijkse polder en Vierambachtspolder. Golfslag en de zuiging van vaarverkeer halen grond weg in een smalle strook vlak boven en onder de waterlijn, en juist daar begint de afkalving. De schouw van het waterschap toetst of de watergang op de voorgeschreven diepte en breedte is; een oever die naar binnen is gezakt, komt daarbij als achterstallig onderhoud naar voren.